高通量定序技術的快速發展正逐漸改變以往我們探討生物醫學的研究方法與觀念，這個技術開展了基因體另一個新的研究方向，不單只是對基礎研究有突破性的貢獻，在個人化醫學的時代也會有重要的角色。目前在整個定序技術的發展過程中，定序資料的分析是一個需要突破的瓶頸，這麼大量的序列資料要如何有效的擷取出我們所需要的資訊，需要有效的開發出針對不同目的之分析流程，結合不同的分析演算法來達成我們要的結果。所以能更快速的建構出這些分析的平台技術將會在未來的基因體與個人化醫學扮演一個重要的領導地位。此次海量數據分析實務研習會就是希望能有效交流目前在定序技術分析的經驗與開發好的分析平台，來加速海量數據分析這個領域的研究能量。
※Workshop全程參與者可獲贈精美小禮物 ※
※參與４ Sections(含以上)者可參加抽獎，大獎為:FUJITSU LIFEBOOK AH544(市價約24,800) ※
| December 3(Wednesday) |
| Time |
Content |
| 08:30-09:00 |
Registration |
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Sequencing Technology 地點: 統一健康大樓B1何曼德講堂 |
| 09:00-09:50 |
The journey of DNA sequencing
孫孝芳老師 (國立成功大學分子醫學研究所) |
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09:50-10:00 |
Break |
| 10:00-10:30 |
Advancing Your Research with Ion Torrent™ Semiconductor Sequencing (Ion PGM)
陳囿任 (Ion Torrent Technical Sales Manager, Thermo Fisher Scientific) |
| 10:30-11:00 |
Next Generation Sequencing application on immune repertoire research
Thomas Yang (Genetech Biotech) |
| 11:00-11:30 |
Applications of PacBio Single Molecule, Real-Time (SMRT) DNA Sequencing.
牟德宜 (Pacific Biosciences) |
| 11:30-12:00 |
Total Solution of NGS workflow in Clinical Application
徐英誠 (Qiagen, TW) |
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12:00-13:30 |
Lunch |
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Target Sequencing (Hands-on Section) 地點: 成功大學醫學院圖書館電腦教室 |
| 13:30-14:20 |
Comprehensive analysis of common coding sequence variants by exome sequencing
林雅琪博士
(國立成功大學基因體醫學中心) |
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14:20-14:30 |
Break |
| 14:30-17:30 |
Using the R package CN.MOPS for CNV detection in NGS population study
鄭順林老師
(國立成功大學統計系) |
| December 4(Thursday) |
| Time |
Content |
| 08:00-08:30 |
Check in |
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Small RNA Sequencing (Hands-on Section) 地點: 成功大學醫學院圖書館電腦教室 |
| 08:30-09:20 |
NGS pipeline for small RNA regulomic study
陳琮明老師
(國立高雄海洋科技大學) |
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09:20-09:30 |
Break |
| 09:30-12:30 |
NGS workflow for miRNA prediction
林雅琪博士 (國立成功大學基因體醫學中心) |
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12:30-13:30 |
Lunch |
|
RNA Sequencing (Hands-on Section) 地點: 成功大學醫學院圖書館電腦教室 |
| 13:30-14:20 |
Translatome analysis by NGS: filling the gap between transcriptome and proteome results
曾大千老師
(國立成功大學生物資訊與訊息傳遞研究所) |
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14:20-14:30 |
Break |
| 14:30-17:30 |
RNAseq data analysis
劉宗霖老師
(國立成功大學生物資訊與訊息傳遞研究所) |
| December 5(Friday) |
| Time |
Content |
| 08:00-08:30 |
Check in |
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de novo Assembly (Hands-on Section) 地點: 成功大學醫學院圖書館電腦教室 |
| 08:30-09:20 |
De novo assembly and gene annotations of Arabidopsis halleri ssp. gemmifera
黃兆立 (國立成功大學生命科學系) |
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09:20-09:30 |
Break |
| 09:30-12:30 |
Genome assembly and annotation using next-generation sequencing data
Yasumasa Shigemoto (Fujitsu) |
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12:30-13:30 |
Lunch |
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Big Data Analysis: Challenges and Solutions
地點: 成功大學醫學院四樓大會議室 |
| 13:30-14:20 |
Big Question 1st Big Data 2nd
呂宗學老師 (國立成功大學公共衛生研究所) |
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14:20-14:30 |
Break |
| 14:30-15:00 |
Powering Global Big Data Collaboration & Breakthrough New Workflows in Life Sciences
Jew Kok Lim (Aspera) |
| 15:00-15:30 |
Ultra-fast real time interactive internet based system of super-high resolution gigapixel images
王靖維博士 (佳儀國際) |
| 15:30-16:00 |
IBM HPC GPFS
李智 (系統與科技事業處 資深顧問) |
| 16:00-16:30 |
The Key Server to Meet the Challenges of Big Data
劉紹志 (Fujitsu Taiwan Ltd) |
| 16:30-17:00 |
Closing Remarks |
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線上報名 - Workshop Registration ※
